История Метода масс-спектромии микробных маркеров.                                    

 

Осипов Георгий Андреевич
Георгий Андреевич Осипов (05.09.1939 – 11.12.2020) – советский и российский микробиолог. Доктор биологических наук (1996), профессор микробиологии (2007), автор метода МСММ (метод масс-спектрометрии микробных маркеров), ведущий научный сотрудник независимой клинико-диагностической лаборатории Института аналитической токсикологии (до 2020 года). Сотрудничество ООО Институт аналитической токсикологии с Георгием Андреевичем началось в мае 2015 года. За это время мы проделали большую работу в области использования масс-спектрометрии в различных областях науки и медицины.  Георгий Андреевич — автор 150 научных работ, 7 авторских свидетельств и патентов.
Научная деятельность

В 1963 году окончил Физико-энергетический факультет Московского Инженерно-Физического института (сейчас является частью и головной площадкой Национального исследовательского ядерного университета «МИФИ»)

С 1963 по 1979 годы работал в Научно-исследовательском институте химии и механики Министерства машиностроения СССР в качестве инженера – старшего научного сотрудника, руководителя группы физических методов исследования. Руководил группой физических методов исследования – ЯМР, ЭПР и ИК-спектроскопия, масс-спектрометрия, рентгенофазовый анализ и электронная микроскопия. В течение пяти лет был ученым секретарем секционного научного совета этого института.

С 1979 по 1995 годы работал в Государственном НИИ биологического приборостроения старшим научным сотрудником, руководителем группы хромато-масс-спектрометрии, где выполнял работы по созданию малогабаритного масс-спектрометра и методики анализа микроорганизмов в экологических пробах. Результатом этих работ явилось создание нескольких макетов пиролитического масс-спектрометра хемодифференциации микроорганизмов в чистых культурах и сообществах. Последние, методические работы вошли в представляемую к защите докторскую диссертацию.

С 1995 по 2013 годы работал ведущим научным сотрудником Академической группы Академика РАМН Ю.Ф. Исакова Научного Центра сердечно-сосудистой хирургии им. А.Н. Бакулева РАМН, а с 2003 года, одновременно, главным научным сотрудником лаборатории клинической микробиологии и антимикробной терапии.

С 2013 года по настоящее время Г.А.Осипов работает в качестве ведущего научного сотрудника в Институте аналитической токсикологии ООО «Интерлаб.»

Методика МСММ

В 1970 году защитил кандидатскую диссертацию по закрытой теме, по специальности химическая физика, а в 1996 году докторскую диссертацию на тему: «Хромато-масс-спектрометрическое исследование микроорганизмов и их сообществ» по специальности «микробиология» — 03.00.07.

В 1997 году разработанный им метод показан на двухмесячном мастер-классе в Департаменте клинической микробиологии Университета Лунда (Швеция). Вместе со шведскими коллегами изучали методом МСММ причину распространенной тогда в Западной Европе респираторной инфекции. Было обнаружено, что трудности в ее лечении связаны с наличием
полимикробной инфекции с Streptococcus pneumonia, Moraxella catarrhalis and Haemophylus influenzae в качестве основных агентов. Г.А. Осипов является ведущим специалистом в области нового направления в молекулярной микробиологии – исследовании количественного состава микробных сообществ непосредственно в клиническом или ином материале по специфическим липидным компонентам микробной клетки без выделения чистых культур микроорганизмов. Эти работы уникальны. Аналоги в России и за рубежом отсутствуют. С 1993 года они регулярно публикуются в отечественной и зарубежной литературе, на научных конференциях разного уровня и направлений. Г. А Осипов разработал универсальный метод анализа микробных сообществ, который в отличие от известного молекулярно-генетического не требует нативного генетического материала в качестве тестового субстрата.

На конференции по молекулярным методам в микробиологии во Франции в 2000 году группой исследователей, руководимой Г.А. Осиповым, представлено 17 докладов с примерами реализации метода в медицине, экологии и биотехнологии. Работы Г.А. Осипова внесли существенный вклад в исследование микроэкологии человека и окружающей среды. Благодаря сотрудничеству с рядом медицинских учреждений и университетских кафедр исследована микробиота практически всех органов человека. Впервые с высокой точностью определен количественный состав микробиоты кишечной стенки и изучено ее изменение при различных заболеваниях кишечника, а также при кожных патологиях. Детально изучен состав микст- инфекции клапанов сердца при эндокардите, врожденном пороке сердца и ишемической болезни. Показано участие анаэробов – симбионтов человека в воспалительных процессах респираторных и урогенитальных органов, полиэтиологичность менингитов. Обнаруженный в результате систематических исследований гомеостаз микробных маркеров в крови и адекватность его профиля составу кишечной микрофлоры здорового человека обеспечил уникальную возможность мониторировать состояние микробиоты кишечника неинвазивным экспрессным методом – по анализу крови. Разработанный Г.А.Осиповым метод позволяет одновременно контролировать маркеры практически всех клинически значимых микроорганизмов – симбионтов человека. Поэтому анализ крови используется в настоящее время для обнаружения воспалений неизвестной этиологии, определения антигенов и их носителей при септических состояниях, лихорадках, аллергиях, артритах и прочих микробозависимых патологиях. Работы Г.А. Осипова внесли существенный вклад в развитие молекулярных методов в микробиологии, в том числе в специальной, клинической микробиологии. Разработанный им метод экспрессного количественного анализа микробных сообществ воспалительных и инфекционных процессах принят к использованию в разное время в лабораториях ДГКБ № 13 им Филатова, НЦ ССХ им А.Н. Бакулева, ФГУ Лечебно-реабилитационный центр Росздрава, Институте биологических проблем РАН и других. В последнем, при консультативном участии Г.А. Осипова, разработана программа и технологическая оснастка периодического контроля микроэкологического статуса космонавтов обитаемой космической станции МКС в процессе длительного полета. В 2004 году принял участие в NASA-Russia Mars Science Summit с докладом об исследованиях микроэкологии земных экстремальных зон – аналогов Марса. Ключевым периодом в изучении микроэкологии человека методом МСММ была серия работ с Институтом гастроэнтерологии в 2000-2004 гг. Обнаруженный в результате систематических исследований гомеостаз микробных маркеров в крови и адекватность его профиля составу кишечной микробиоты здорового человека обеспечил уникальную возможность мониторить состояние микробиоты кишечника неинвазивным экспрессным методом – по анализу крови.
В 2005-2016 годы – работал в Лечебно-реабилитационном центре Росздрава РФ по обеспечению экспрессного анализа инфекции пациентов различных отделений центра. В 2016 г там впервые осуществлен 10-дневнй мониторинг микроэкологического статуса пациента отделения реанимации неврологии с частотой забора проб крови на МСММ анализ каждые 3 часа.

В 2010-2015 годы Осипов Г.А. внедрял метод МСММ в НИИ скорой помощи им Склифосовского. Впервые был осуществлен мониторинг инфекции и дисбиоза у септических больных отделений реанимации и интенсивной терапии.

С 2015 по 2020 год Г.А.Осипов работал в качестве ведущего научного сотрудника в ООО «Институт аналитической токсикологии».

Преподавательская деятельность

Г.А.Осипов проводил большую педагогическую и организационную работу по подготовке кадров и организации исследований методом масс-спектрометрии микробных маркеров в различных медицинских учреждениях г. Москвы и некоторых других городов России. Работа была связана с проведением лекций, семинаров, обучением студентов и аспирантов, консультациями для врачей и микробиологов. Им был прочитан курс лекций по масс-спектрометрии микробных маркеров в Московском государственном университете им. М.В.Ломоносова, в Российском государственном медицинском университете и в Ярославском государственном университете им. Демидова и в Институте PreventAge. Г.А.Осипов регулярно участвовал в консультировании и руководстве

студенческих курсовых и дипломных работ в этих университетах. Под руководством и при консультации Г.А. Осипова защищены 11 кандидатских и 3 докторских диссертационных работ в различных областях медицинской науки. Учитывая большую значимость для науки и практики исследований Г. А. Осипова и его большой вклад в подготовку специалистов высокой квалификации, по ходатайству Ученого совета Научного Центра сердечно-сосудистой хирургии им А.Н.Бакулева РАМН в 2007 году ВАК РФ присвоил Г.А.Осипову ученое звание «профессор» по специальности «микробиология» — 03.00.07. С 2015 года по 2020 год Г.А.Осипов работал в качестве ведущего научного сотрудника в Институте аналитической токсикологии ООО Интерлаб. Им были проведены работы по развитию технологии и автоматизации метода МСММ, лекции и консультации врачей и пациентов по интерпретации данных. Проведен ряд внедрений Микробиологического анализатора Маэстро и технологии МСММ в Москве и других городах России – Санкт-Петербурге, Владивостоке, Улан-Удэ, Красноярске, Нижневартовске, Челябинске, Ростове, а также в Туркмении.
Основные труды
Г.А.Осипов является автором более 150 печатных работ, опубликованных в российских и зарубежных научных журналах. В их числе семь авторских свидетельств и патентов на изобретение и главы в четырех монографиях, а также ряда пособий для врачей по методу МСММ. Значительная часть работ посвящена изучению экологических микробных сообществ в почве, донных отложениях водоемов, мерзлотных грунтах Арктики и Антарктики. Г. А Осипов консультировал более десяти кандидатских диссертаций, выполненных в этой области с применением метода МСММ.